• Аквакультура (обследование, очистка, ремонт загонов для разведения рыбы);
• Военные и антитеррористические применения;
• Поисково-спасательные работы;
• Измерение кислотности воды (контроль pH). Робот-рыба проконтролирует кислотность воды. Актуаторы из сплавов с памятью формы, которые изгибают гибкую структуру, играющую роль скелета робота;
• Изучение океанических течений. Исследования океана, морской флоры и фауны;
• Геология. Подводная геология, например, поиск природных ископаемых, их добыча;
• Морские фермы с автоматическими системами для разведения рыбы;
• Телеком. Участие в обследовании подводных кабелей, прокладке подводных кабелей;
• Обследования опасных объектов, подводных частей торосов и айсбергов, подводных вулканов, плотин ГЭС;
• Очистка корпусов судов; 
• Энергетика.  Обследование размещенных под водой механизмов и устройств, например, принадлежащих нефтяникам морских платформ, обследование подводной инфраструктуры морских ветроэлектростанций;
• 3D-съемка донного рельефа. 

Для определения собственного положения под водой роботы обычно используют системы инерциальной навигации. Они представляют собой набор акселерометров, регистрирующих ускорения и маневры аппаратов. Периодически аппараты всплывают для сверки координат и коррекции инерциальных систем по GPS. Подводные роботы сегодня активно используются и в военных, и в гражданских целях.